2012年R1 做了小小的修改，在硬體部份的車架、引擎維持不變，但修改了ECU 設定，並加入6段可調循跡控制系統。另外則是外形部份，頭罩部份略為修改，加入LED 燈眉，並換上不同的把手蓋與排氣管防燙蓋，同年也推出慶祝YAMAHA 參加MotoGP 50 週年配色版本。
2012年R1 外型加入LED 燈眉。
2012年慶祝YAMAHA 參加MotoGP 50 週年的紀念配色R1。
2015 七代YZF-R1 998cc 200ps
充滿YZR-M1 外型影子的第七代R1。
第七代R1 雖然保持998cc 排氣量，但行程再次縮短1.3mm，缸徑行程為79 x 50.9mm，並搭配鈦合金曲軸連桿，讓引擎轉速提升，將動力曲線進一步往高轉大馬力的方向移動，最大馬力達到200ps。而全車使用包括鋁合金油箱、鑄造鎂合金框、輕量鍛造鋁合金活塞、鎂合金油底殼與輕量化車架等等，讓第七代R1 的濕重僅有199kg，達到濕重的馬力重量比1：1的境界。
煞車在第七代R1 再度改回四活塞卡鉗，但採用更大的活塞口徑，因此碟盤尺寸也加大回320mm。同時為了強化彎道性能，軸距也進一步的縮短，比起前一代R1 縮短10mm。
車架引擎都做了大幅度的革新。
而第七代R1 最突破性的進化並非機械性的部份，而是導入大量自MotoGP 下放的電控系統，這也是日本車廠第一款大量搭載輔助電控的車款。除了傾角感應式循跡控制與動力模式之外，還有電子聯動煞車、ABS、彈射起步控制、孤輪抑制、滑動控制系統、快排，而這些全都是建立在內建的六軸感應器之上，讓上述電控的介入精準度能媲美廠車水準。
大量電控的導入，讓第七代R1 再次成為日系車款的領頭羊。
第七代R1 發表的同時，也同步發表性能強化版的R1M，全車搭配Carbon 整流罩，Ohlins 半主動電子懸吊，並將通訊控制單元（CCU）列為標準配備，是一輛專為賽道而生的版本。雖然並非限量版，但因產能問題，每年配額也有限。
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原廠搭配電子懸吊與Carbon 整流罩的R1M。
在2016年，除了原本的R1 與高性能R1M 外，在北美市場另外推出了更平價的R1S。主要改變在動力心臟部份，引擎曲軸連桿並非標準版的鈦合金材質，因而讓引擎轉速有所限制，ECU Map 也做了相對應的修改，讓R1S 相對R1 更著重中低轉速的輸出。R1S 的馬力略小，車重略重，但電控配備則是一樣不缺，用以滿足沒有賽道需求的車主。
取消鈦合金連桿等高單價輕量化零件的R1S
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