YZF-R3車主公認的兩大缺點：
第二名：激烈操駕下制動力道稍嫌不足（34%）
許多車主抱怨YZF-R3有前煞車制動力不足、不夠線性的問題，當然這或多或少與騎士使用煞車的習慣有所關聯，畢竟R3還是屬於適合街道騎乘的車款，一般原廠提供的制動力其實是足夠的，但仍有些車主表示煞車時信心不足。若有在山道、賽道較激烈操駕的需求，前煞車或許需要進行一點調整。
激烈操駕時，前煞車制動力不足是車友們覺得可以改善的地方。
第一名：後避震與前叉不搭（37%）
新款的YZF-R3對前叉進行了升級，但在後避震的配置並沒有大幅度的提升，雖然應付通勤綽綽有餘，但在以較快的速度處理彎道時，尤其是連續彎跟高速彎，較容易有多餘的晃動，造成車尾帶來的不安定感，形成後懸吊跟不上前懸吊的尷尬處境。
後懸吊與前懸吊的搭配性有些不協調。
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