而YAMAHA 在2006年分別推出的黃白配色搭配黑色速度鏈塊的創廠50週年紀念R6 與R1，由於2006年正逢R6 大改款，也讓50週年R6 顯得相當熱門，台灣當時也進了一些50週年R6，車上也都有限量編號。
2006年推出的YAMAHA Motor 50週年紀念配色R1
2006年50週年配色R6。
然而不少年輕車友比較有印象的，就是2012年所推出的紅白配色搭配紅色速度鏈塊的R1，雖然也是50週年，但卻是指YAMAHA 參加WGP 50週年紀念，與2006年的創廠其實不同。當年除了R1 之外，包括R6、R125、FZ8 都有推出50週年配色，而YAMAHA GP 廠隊也分別在Laguna Seca、美國印地站、日本站以50週年紀念塗裝的M1 參賽。參與WGP 50週年的紅色鏈塊設計也與當年1978年的YZR500的彩繪略有不同，鏈塊呈現是由大至小，強化速度感，另外中央也有紅色色塊貫穿全車，是與當時彩繪些許的不同。
2012年YAMAHA 主推的參加WGP 50週年的紀念配色。
既然是參加WGP 50週年，自然也會和MotoGP 結合。
2011年Ben Spies 騎乘50週年配色M1 參賽。
2011 年Lorenzo 騎乘50週年配色M1 參賽。
2012年R6 也有推出50週年配色。
2012年50週年配色R125。
