車主公認的四大缺點
第一名：前懸吊表現仍有改善空間（24%）
在前懸吊上，CB650R使用上了41mm的Showa SFF倒立式前叉，然而對於部分車主而言，他們認為CB650R的前倒叉偏舒適取向。在一般道路使用時，前懸吊的表現尚算不錯，但在山路中想要進行熱血操駕時，前懸吊的支撐性便會顯得略為不穩定和不足。這問題受到24%的受訪車主同意，成為車主公認的最大缺點。
對於部分車主而言，CB650R的前懸吊表現仍有改善空間。
第二名：原廠馬力閹割問題（16%）
為配合台灣的環保法規，HONDA Taiwan所引進的CB650R是馬力經過下修的版本，因此被部分車主認為車輛的馬力受到「閹割」。對於這個問題，總代理提供更換全馬力版本電腦的服務，然而這是購車後需要另外付費的。這樣的馬力閹割問題，讓不少車主即便已花錢更換全馬力電腦仍心有戚戚焉。畢竟明知道自己的愛駒可以爆發出更強大的性能，卻又礙於法規的限制只能被迫接受現實或是額外花錢解決，難免讓車主們心裡很不是滋味。
部分車主對馬力被下修的問題，在購車後仍心有戚戚焉。
第三名：制動力略為不足 （12%）
CB650R車主公認的第三大缺點在於不少車主認為其制動力不太足夠，約12%的受訪車主均表示在需要緊急煞車時情況時，煞車系統為他們帶來的制動力頂多只能說是「堪用」，也有車主直接指出後煞車的不足。但整體而言12%的車主裡，大都認為制動力只是略為不足，而不至於嚴重不足。針對這個問題，車主們也許可以考慮藉由升級金屬油管、來令片、煞車總泵和卡鉗等煞車系統相關配備，以達提升制動力的效果，讓行車安全更有保障。
部分車主認為CB650R的制動力略為不足，尤其後煞車的部分。
第四名：原廠輪胎規格問題 （12%）
最後，12%的受訪車主認為原廠在CB650R上採用的輪胎規格傾向休旅、舒適取向，犧牲了不少車輛本身的操控性。對此，部分車主表示換上較為性能取向的輪胎後，CB650R原本經已非常不錯的操控性仍然可以明顯的提升。對於常進行熱血操駕或常到山路體驗操控樂趣的車主而言，想要追求更好的操控性時，不妨先從將輪胎著手。
部分車主認為CB650R原廠輪胎規格不佳，在激烈操駕時不太夠用。
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