2014年Pedrosa意識到自己的騎乘風格必須有所突破，才能抵禦Marquez及其他車手，但依舊擋不住Marquez的火燙氣焰，拿下令人瞠目結舌的開季十連勝，成為擁有五座GP冠軍獎座的Mick Dooham後第一人，開啟了非常瘋狂的賽季，也許是長年下來累積的傷勢影響，在這一年Pedrosa出現了骨筋膜室綜合症，但照樣忍著痛帶傷上陣，在捷克站中拿下分站冠軍，只是傷還未痊癒的情形下，影響了後面賽季的發揮，遍體鱗傷的Pedrosa也還是沒有怨言。
很快地，骨筋膜室綜合症影響了Pedrosa的右前臂，使他無法順利的操控賽車，新賽季初又缺席了三個分站，因此HONDA有意找Stoner代班並讓Pedrosa能好好的休養一個賽季，但急著復出的Pedrosa認為自己還能有所貢獻，在法國站強勢的回歸，後半賽季也有愈跑愈好的跡象，而在Rossi與Marquez因護航問題而連日不休的爭吵激辯下，還是穩穩地跑完整個賽季，HONDA也逐漸認為，Pedrosa已不再未來的藍圖之中，資源也慢慢移轉在Marquez身上。
2016賽季在改造的RC213V身上，Pedrosa似乎沒有找到適合的車輛設定，不上不下的成績讓Pedrosa吃了不少苦頭，反觀隊友Marquez再次顯露才華，奪下第三座GP世界獎盃，自己則是僅拿下生涯最差的年度第6，隔年在各個廠隊車手陣容將要大洗牌的情況下，Pedrosa的廠隊位置有可能不保，但HONDA還是維持原班人馬，不離不棄的選擇與Pedrosa續約兩年，繼續為HONDA來效力，已不再有年紀優勢的Pedrosa，需要一個觸底反彈的機會，為世界冠軍做最後一搏。
當多數轉隊的車手還在尋找車感時，可以預期的是Pedrosa會有相當多的機會站上頒獎台，相較於去年成績，Pedrosa確實有明顯的進步，但還是沒有辦法衝擊到世界冠軍，不過穩健的表現與隊友Marquez拿下了車隊冠軍，而Pedrosa自己也相當清楚，自己早已不是HONDA當年的未來之星，也不是年輕力盛的小夥子，對於尚在而立之年的Pedrosa來說，冠軍榮耀已不再是那麼重要，享受著比賽似乎已深植在Pedrosa心中，默默尋找著當初騎車的意義。
而在今年糟糕的成績，與2014年的骨筋膜室綜合症成為摧毀他職業生涯最後一根稻草，HONDA選擇與Lorenzo簽約與Marquez組成夢幻雙人組，也讓Pedrosa萌生了退休的意願，在與媒體的記者會中每個人都明白這件事遲早要來臨，最後他也清楚的表示：「我想明年我不會參加MotoGP的賽事，這是一個很困難的決定，我已經考慮了很久，儘管我還有機會可以繼續比賽下去，但我已經不再有競爭力，我很幸運有一段不可思議的旅程，實在是令人難以置信，當我小時候看到電視轉播世界冠軍的比賽時，我想我永遠達不到那些成就，而現在似乎已超出我的預期。」而當記者問到有什麼值得回憶的時刻時，Pedrosa笑著回答：「每個時刻都是無可取代的，你必須充分的去享受，MotoGP是一個奇妙的地方，所發生的一切都會帶給你一些領悟，讓你更加的了解自己，我記得當我開始比賽時，我是最年輕的車手，其他車手比我大的多，而現在，我長大了。」即便在宣布職業生涯即將結束的重要時刻，Pedrosa還是放下身段、強顏歡笑，一一耐心親切地道出記者所問的問題，與總是笑容常開的形象相吻合，或許那種不出風頭的低調個性才是他在場上唯一的缺點，在經歷過數不清的各種危害生涯的傷勢及低潮，始終保持著堅強的求勝意志，以及在陣中角色不停的轉換卻始終留在HONDA效力，為了完成責任而願意付出一切，無愧對安全帽頂上大大的「侍」字，讓我們對Pedrosa肅然起敬，即便生涯沒有GP世界冠軍的榮耀，Pedrosa用場上的表現贏得了大家的尊重，不放棄的精神一直存在無數車迷的心中，成為一個時代的經典人物，謝謝你Pedrosa，就請你盡情享受剩下騎車時光吧，也祝福你的退休人生能過得充實，去完成尚未實現的夢想。但或許在某一天，Pedrosa將會在MotoGP上尋找到屬於自己的下一個定位點，如同Crazy Stone為Ducati擔當測試車手這類工作，繼續為兩輪賽事發光發熱，繼續奔馳下去。
引退記者會。
Pedrosa賽場上英姿。
